VirtualBox: Reduzindo imagens VDI
As imagens VDI são dinamicamente expansíveis. Isto é legal, porque é possível criar um arquivo pequeno que vai crescendo a medida que o disco da máquina virtual precisa armazenar mais arquivos. Mas se depois de um tempo você liberar espaço no “disco virtual”, o arquivo VDI não é reduzido.
Para resolver isto, é preciso seguir as seguintes etapas:
Zerar os setores não utilizados no sistema de arquivos virtual do arquivo VDI. Se o sistema convidado for Linux, você provavelmente vai encontrar uma solução com o dd. No meu caso, o sistema virtual era o Windows XP, então utilizei o aplicativo ccleaner que, além de remover arquivos desnecessários, possui a opção (em avançado) de preencher com zero o espaço livre.
Rode o seguinte programa (na máquina hospedeira):
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Aqui consegui reduzir de 5 para 3,8GB o meu arquivo.
Fonte: http://www.vivaolinux.com.br/dica/VirtualBox-Reduzindo-imagens-VDI